Dans des cas rarissimes, des problèmes d'ordre génétique peuvent être la cause des bronchites chroniques. Il existe notamment un syndrome de cils immobiles, dont la transmission est héréditaire. Chez les personnes touchées (moins d'une personne sur 25.000), les cils bronchiques sont immobiles et incapables d'évacuer normalement le mucus, provoquant une bronchite chronique.
L'asthme peut aussi être un facteur de risque de bronchite chronique.