La fièvre jaune sévit dans les régions intertropicales d'Amérique centrale et australe, et surtout d'Afrique, où se concentrent 95% des cas recensés.
Selon le milieu où elle sévit et le moustique incriminé, on distingue 3 types de fièvre jaune:
- fièvre jaune selvatique: dans la forêt tropicale, la fièvre jaune est entretenue par un cycle moustique infecté-singe-moustique. Quand des hommes pénètrent dans la forêt (par exemple des bûcherons), ils peuvent être piqués par les moustiques infectés.
- fièvre jaune rurale: de petites épidémies, appelées flambées, surviennent souvent dans les zones humides ou semi-humides. Des moustiques semi-domestiques (qui se reproduisent aussi bien en pleine nature qu'aux abords de zones habitées) sont infectés et propagent la fièvre jaune dans les villages.
- fièvre jaune urbaine: de grandes épidémies peuvent se déclarer quand des moustiques infectent les personnes non immunisées dans des zones densément peuplées.